鱼油从冷水油鱼中提取，是omega-3长链必需脂肪酸的天然来源。然而，冷水鱼并不像大多数人认为的那样制造这些酸，而是通过消耗产生这些酸的藻类或小鱼将它们积聚在脂肪组织中。不幸的是，环境毒素也是以这种方式储存的，这使得经常食用某些掠食性鱼类成为一种危险的提议，特别是那些在已知被污染的水域捕捞的鱼类。出于这个原因，大多数作为膳食补充剂的鱼油都要经过“脱盐技术”，也就是说，在被包装成胶囊和软胶囊之前，鱼油要经过分子蒸馏和其他净化程序来清除毒素和污染物。食用鱼油作为膳食补充剂的最佳量取决于为什么需要它以及某些Omega-3酸与其他的比率。
在鱼油中发现的主要的Omega-3脂肪酸被认为是对健康有益的是二十碳五烯酸(EPA)和二十二碳六烯酸(DHA)。一般来说，一种高质量的补品平均能提供1000毫克的肠溶胶囊，EPA和DHA的比例分别为12%和28%。然而，有一些补充剂可以提供更高比例的EPA或DHA。此外，还有一种半合成的乙酯，这种浓缩物能提供高达85%的EPA和DHA的总浓度，而不是通常的30%。还应该指出的是，摩洛哥、智利和秘鲁的鱼油产量比其他地区多出约30%的omega-3酸，而新西兰南部海岸附近的水域被认为几乎是零污染的。
大多数鱼油补充剂生产商都建议消费者每天服用一到两粒鱼油胶囊，通常总含量为1,000-2,000毫克。然而，关于每天应该摄入多少这种物质，几乎没有官方的指导，至少在美国没有。例如，美国食品和药物管理局(Food and Drug Administration)尚未给出推荐的EPA和DHA的每日摄入量。另一方面，美国心脏协会鼓励消费者每周吃两份四盎司的鱼，这相当于每周吃两次约3000毫克的鱼油。
如前所述，如果目的是预防或改善某一特定情况，建议的鱼油剂量可能略有不同。例如，一般建议对抗雷诺氏病或克罗恩病的患者服用2000毫克，每天两次，总共4000毫克，而狼疮患者服用2000毫克，每天三次，总共6000毫克，效果会更好。对于大多数其他疾病，包括哮喘、风湿性关节炎和高血压，每天服用三次1000毫克的治疗方案似乎效果良好。